给畜禽接种疫苗是预防传染性疫病的主要方法之一，牛、羊、猪、鸡养殖过程中都需要这样做，特别是鸡，整个养殖周期可能要做十几次免疫，养驴却可以不用接种任何疫苗，因为驴的传染性疫病相对较少，而且发病率相对较低，仅做好饲养管理、卫生消*等工作便可以较好的避免驴传染性疫病的发生。不过驴虽无太多传染性疫病，但是消化道疾病和寄生虫病却比较多，养殖户应加强相关防治工作才可以。
一、消化道疾病驴之所以容易出现消化道疾病，主要与驴的消化特点有关，驴虽然属于草食性动物，但却又属于单胃动物，不能对草料进行反刍、发酵分解，因此一些劣质、柔软的草料并不能得到较好的消化，容易在胃肠形成草团造成胃肠梗阻，也就是养殖户常说的“结症”。再者驴胃容积远不如牛羊，大部分的草料都存在于肠道内，当受到惊吓或其他刺激时便容易造成肠扭转。最后依旧是因为驴胃容积小，当采食易发酵或难消化的草料时，特别容易存在胃中并发酵产气，这样便会造成急性胃扩张。
预防驴消化道疾病的发生，应多在饲养管理上下功夫，首先草料必须符合干、硬、脆的特点，例如谷草、大豆秸秆及芦苇等，其次草料必须干净无污染无霉变，最后则是定时、定量进行饲喂。此外还应给驴供给充足的清洁饮水，特别冬季应尽量饮温水，以免冷水、冰冻水对驴胃肠造成刺激。
二、寄生虫病驴容易患疥螨、胃蝇蛆、蛲虫、蟠尾丝虫等寄生虫病，不仅会影响驴对营养的吸收，而且还会消耗驴体的营养，时间长了驴便会出现消瘦、脱毛等表现。预防寄生虫病可每年3~4月，9~10月份分别采用伊维菌素皮下注射+阿苯达唑内服进行联合驱虫，5~6月份采用0.01%敌百虫溶液喷体驱虫，驱虫期间粪污一定要及时清理并严格消*，以免环境中的寄生虫或虫卵再次对驴群造成感染。平时做好驴舍内外的卫生工作，将粪污及时清理干净，避免长时间在驴舍内堆积，并定期对驴舍内外环境及饲槽等进行消*。天气良好的情况下应将驴赶至运动场晒太阳，同样可以在一定程度上预防寄生虫病的发生。